說到干熱滅菌與微波滅菌的區別，從定義上來看，干熱滅菌在火焰或干熱空氣這種環境下進行滅菌操作。微波滅菌則是微波與物料直接相互作用，將超高頻電磁波轉化為熱能的過程。關于它們的不同之處，將在以下內容具體展現。

干熱滅菌

這也是為了達到滅菌效果常用的手段之一。它是指用高溫干熱空氣滅菌的方法，該法適用于耐高溫的玻璃和金屬制品以及不允許濕熱氣體穿透的油脂的滅菌，不適合橡膠、塑料及大部分藥品的滅菌。常用的裝置是干熱滅菌箱。內部循環熱風經高溫高效空氣過濾器過濾，保證了進入有效空間的熱風達到100級潔凈要求。

微波滅菌

就該方法而言，由于微波穿透性強，滅菌時間大大縮短，但由于微波照射時，物料不同郡位由于與微波管的距離不同便各部位接受的微波強度差別，甚至會有“角”，造成滅菌的不完整性。一般適用于醫藥、食品行業的粉狀、粒狀、條狀等固體物料、各種袋裝物料的滅菌。